不少瑜伽学员反映除了练习瑜伽之后身体发生改变的喜悦，更是亲身体验了瑜伽对身体的诸多益处，尤其是神经系统和内分泌系统。
一个人的行为，情绪，甚至心理状态都和内分泌腺体的活动有直接的关联。内分泌腺体制造的化学物质(激素或者叫做荷尔蒙)是直接分泌到血流之中的，血液把这些化学物质送到全身各处。当内分泌腺体释放太多或太少某些荷尔蒙到血液中去时，人的身心健康就会受到不良影响。大家知道，内分泌系统是受到自主神经系统支配影响的。而没有任何锻炼体系能像瑜伽练习那样有益于整个神经系统。事实上，瑜伽体式当中看似匪夷所思的弯、伸、扭、推、挤都可以直接使身体主动的按摩和滋养各内分泌腺体。
举例来说：头倒立式，涌入脑子的血流增大对松果腺和脑下垂体有益。束角式和坐角式由于对下腹部特殊的挤压从而刺激旺盛卵巢功能，使所有作这姿式的
女士给自己做了一次适度的卵巢保养。
虽然瑜伽对调节内分泌有奇效。但就象中药店中的各色补药，也不是拿过来就能用的。比如瑜伽中著名的弓式，
它对胰腺有良好的调节作用，但是由于它旺盛甲状腺，所以甲亢的朋友就是被禁止练习的。正因为如此，练习瑜伽一定要选择专业的场馆和教练。另外，冬日来临，尽量不要在过低的环境中练习，高温瑜伽是很不错的选择，不仅舒服，还可以使肌肉和韧带尽量放松有弹性，以便很好地保护这些部位避免过于紧张而造成的损伤。此外，欲了解瑜伽受伤的正确处理过程 可阅读：瑜伽受伤的正确处理过程
